Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
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Rpl28P41105 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
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