Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
VhlP40338 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
VhlP40338 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
VhlP40338 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
VhlP40338 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
VhlP40338 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
VhlP40338 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
VhlP40338 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
VhlP40338 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
VhlP40338 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
VhlP40338 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
VhlP40338 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
VhlP40338 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
VhlP40338 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
VhlP40338 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
VhlP40338 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
VhlP40338 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
VhlP40338 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
VhlP40338 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
VhlP40338 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
VhlP40338 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
VhlP40338 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
VhlP40338 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
VhlP40338 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
VhlP40338 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
VhlP40338 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
VhlP40338 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
VhlP40338 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
VhlP40338 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
VhlP40338 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
VhlP40338 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
VhlP40338 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
VhlP40338 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
VhlP40338 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
VhlP40338 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
VhlP40338 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
VhlP40338 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
VhlP40338 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
VhlP40338 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
VhlP40338 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
VhlP40338 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
VhlP40338 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
VhlP40338 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
VhlP40338 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
VhlP40338 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
VhlP40338 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
VhlP40338 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
VhlP40338 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
VhlP40338 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
VhlP40338 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
VhlP40338 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
VhlP40338 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
VhlP40338 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
VhlP40338 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
VhlP40338 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
VhlP40338 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
VhlP40338 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
VhlP40338 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
VhlP40338 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
VhlP40338 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
VhlP40338 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
VhlP40338 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
VhlP40338 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
VhlP40338 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
VhlP40338 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
VhlP40338 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
VhlP40338 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
VhlP40338 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
VhlP40338 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
VhlP40338 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
VhlP40338 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
VhlP40338 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
VhlP40338 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
VhlP40338 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
VhlP40338 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
VhlP40338 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
VhlP40338 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
VhlP40338 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
VhlP40338 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
VhlP40338 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
VhlP40338 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
VhlP40338 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
VhlP40338 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
VhlP40338 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
VhlP40338 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
VhlP40338 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
VhlP40338 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
VhlP40338 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
VhlP40338 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
VhlP40338 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
VhlP40338 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
VhlP40338 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
VhlP40338 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
VhlP40338 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
VhlP40338 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
VhlP40338 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
VhlP40338 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
VhlP40338 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
VhlP40338 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
VhlP40338 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms