Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Ighv14-3-201ENSMUST00000103469 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Crygf-202ENSMUST00000114027 594 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Rps18-ps1-201ENSMUST00000120838 459 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PtprmP28828 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Gm5808-201ENSMUST00000178090 357 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Mir6934-201ENSMUST00000183965 62 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Fibp-205ENSMUST00000225141 1209 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Gm5292-201ENSMUST00000073317 580 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Speer4f1-201ENSMUST00000076099 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtprmP28828 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprmP28828 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Gm5254-201ENSMUST00000188353 977 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprmP28828 4930444A19Rik-202ENSMUST00000190007 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Gm7445-201ENSMUST00000192115 340 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Fkbp6-202ENSMUST00000201534 1287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprmP28828 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Ptma-201ENSMUST00000045897 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Nt5dc1-202ENSMUST00000099973 761 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtprmP28828 AC154433.1-201ENSMUST00000224401 1183 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PtprmP28828 AC118639.1-202ENSMUST00000226957 653 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PtprmP28828 CT571271.1-201ENSMUST00000227071 670 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PtprmP28828 AC107711.4-201ENSMUST00000228948 440 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Clec1b-201ENSMUST00000032262 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Ggta1-201ENSMUST00000044255 1221 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Mettl18-202ENSMUST00000111490 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtprmP28828 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtprmP28828 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtprmP28828 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Gas7-202ENSMUST00000108680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Gm4858-201ENSMUST00000179064 735 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
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