Protein–RNA interactions for Protein: P15620

Znf271, Zinc finger protein 271, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf271P15620 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf271P15620 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf271P15620 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf271P15620 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf271P15620 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf271P15620 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf271P15620 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf271P15620 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf271P15620 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf271P15620 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf271P15620 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf271P15620 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf271P15620 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf271P15620 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf271P15620 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf271P15620 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf271P15620 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf271P15620 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf271P15620 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf271P15620 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf271P15620 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf271P15620 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf271P15620 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf271P15620 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf271P15620 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf271P15620 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf271P15620 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf271P15620 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf271P15620 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf271P15620 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf271P15620 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf271P15620 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf271P15620 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf271P15620 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf271P15620 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf271P15620 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf271P15620 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf271P15620 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf271P15620 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf271P15620 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf271P15620 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf271P15620 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf271P15620 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf271P15620 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf271P15620 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf271P15620 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf271P15620 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf271P15620 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf271P15620 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf271P15620 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf271P15620 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf271P15620 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf271P15620 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf271P15620 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf271P15620 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf271P15620 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf271P15620 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf271P15620 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf271P15620 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf271P15620 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf271P15620 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf271P15620 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf271P15620 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf271P15620 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf271P15620 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf271P15620 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf271P15620 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf271P15620 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf271P15620 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
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Znf271P15620 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf271P15620 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf271P15620 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf271P15620 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf271P15620 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf271P15620 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf271P15620 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf271P15620 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf271P15620 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf271P15620 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf271P15620 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf271P15620 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf271P15620 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf271P15620 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf271P15620 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf271P15620 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf271P15620 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf271P15620 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf271P15620 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf271P15620 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf271P15620 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf271P15620 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf271P15620 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf271P15620 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf271P15620 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf271P15620 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf271P15620 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf271P15620 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf271P15620 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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