Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
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