Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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