Protein–RNA interactions for Protein: O70491

Stra6, Receptor for retinol uptake STRA6, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra6O70491 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Stra6O70491 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Stra6O70491 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Stra6O70491 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Stra6O70491 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Stra6O70491 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Stra6O70491 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Stra6O70491 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Stra6O70491 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Stra6O70491 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Stra6O70491 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Stra6O70491 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Stra6O70491 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Stra6O70491 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Stra6O70491 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Stra6O70491 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Stra6O70491 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Stra6O70491 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Stra6O70491 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Stra6O70491 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Stra6O70491 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Stra6O70491 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Stra6O70491 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Stra6O70491 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Stra6O70491 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Stra6O70491 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Stra6O70491 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Stra6O70491 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Stra6O70491 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms