Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

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Length 966 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Pkd2O35245 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Pkd2O35245 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
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Pkd2O35245 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Pkd2O35245 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Pkd2O35245 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Pkd2O35245 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Pkd2O35245 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pkd2O35245 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
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Pkd2O35245 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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