Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms