Protein–RNA interactions for Protein: O09102

Gcm2, Chorion-specific transcription factor GCMb, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcm2O09102 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gcm2O09102 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gcm2O09102 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gcm2O09102 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gcm2O09102 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gcm2O09102 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gcm2O09102 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gcm2O09102 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gcm2O09102 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gcm2O09102 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gcm2O09102 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gcm2O09102 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gcm2O09102 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gcm2O09102 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gcm2O09102 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gcm2O09102 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gcm2O09102 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gcm2O09102 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gcm2O09102 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gcm2O09102 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gcm2O09102 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gcm2O09102 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gcm2O09102 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gcm2O09102 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gcm2O09102 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gcm2O09102 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gcm2O09102 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gcm2O09102 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gcm2O09102 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gcm2O09102 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gcm2O09102 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gcm2O09102 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gcm2O09102 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gcm2O09102 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gcm2O09102 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gcm2O09102 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gcm2O09102 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gcm2O09102 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gcm2O09102 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gcm2O09102 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gcm2O09102 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gcm2O09102 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gcm2O09102 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gcm2O09102 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gcm2O09102 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gcm2O09102 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gcm2O09102 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gcm2O09102 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gcm2O09102 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gcm2O09102 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gcm2O09102 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gcm2O09102 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gcm2O09102 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gcm2O09102 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gcm2O09102 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gcm2O09102 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gcm2O09102 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gcm2O09102 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gcm2O09102 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gcm2O09102 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gcm2O09102 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gcm2O09102 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gcm2O09102 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gcm2O09102 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gcm2O09102 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gcm2O09102 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gcm2O09102 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gcm2O09102 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gcm2O09102 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gcm2O09102 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gcm2O09102 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gcm2O09102 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gcm2O09102 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gcm2O09102 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gcm2O09102 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gcm2O09102 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gcm2O09102 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gcm2O09102 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gcm2O09102 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gcm2O09102 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gcm2O09102 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gcm2O09102 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gcm2O09102 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gcm2O09102 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gcm2O09102 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gcm2O09102 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gcm2O09102 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gcm2O09102 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gcm2O09102 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gcm2O09102 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gcm2O09102 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gcm2O09102 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gcm2O09102 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gcm2O09102 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gcm2O09102 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gcm2O09102 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gcm2O09102 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gcm2O09102 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gcm2O09102 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gcm2O09102 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms