Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms