Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

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Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Taf4bG5E8Z2 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Taf4bG5E8Z2 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Taf4bG5E8Z2 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Taf4bG5E8Z2 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Taf4bG5E8Z2 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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