Protein–RNA interactions for Protein: G5E8G2

Usp17ld, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein D, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17ldG5E8G2 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp17ldG5E8G2 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp17ldG5E8G2 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp17ldG5E8G2 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp17ldG5E8G2 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp17ldG5E8G2 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp17ldG5E8G2 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp17ldG5E8G2 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp17ldG5E8G2 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp17ldG5E8G2 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp17ldG5E8G2 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp17ldG5E8G2 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp17ldG5E8G2 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp17ldG5E8G2 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp17ldG5E8G2 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp17ldG5E8G2 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp17ldG5E8G2 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp17ldG5E8G2 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp17ldG5E8G2 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp17ldG5E8G2 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp17ldG5E8G2 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp17ldG5E8G2 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp17ldG5E8G2 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp17ldG5E8G2 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp17ldG5E8G2 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp17ldG5E8G2 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp17ldG5E8G2 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp17ldG5E8G2 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp17ldG5E8G2 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp17ldG5E8G2 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp17ldG5E8G2 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp17ldG5E8G2 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp17ldG5E8G2 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Gm6630-201ENSMUST00000119199 454 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Gm25998-201ENSMUST00000175397 53 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms