Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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