Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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