Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 AC154552.6-201ENSMUST00000221365 1342 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Cryzl1-202ENSMUST00000114023 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Gm8676-201ENSMUST00000184206 637 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Scgb2b31-ps-201ENSMUST00000188734 328 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Scgb2b32-ps-201ENSMUST00000190326 337 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Gm43460-201ENSMUST00000202491 1057 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Gm44432-201ENSMUST00000203342 938 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Gm45458-201ENSMUST00000209900 522 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Gm5374-202ENSMUST00000222910 314 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Gm25135-201ENSMUST00000082648 143 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Olfr1079-201ENSMUST00000099882 948 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Vmn1r66-201ENSMUST00000060374 1524 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Platr22-201ENSMUST00000181274 1617 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Csnk2a1-ps-201ENSMUST00000118846 1175 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Gm12735-201ENSMUST00000146218 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Gm20663-201ENSMUST00000176647 474 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 1700034K08Rik-202ENSMUST00000188082 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Rpap3-ps1-201ENSMUST00000190928 454 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Gm6290-201ENSMUST00000207666 1158 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Gm45732-201ENSMUST00000212460 586 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Rnf212b-201ENSMUST00000218311 1201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Klri1-201ENSMUST00000088046 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms