Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 H2-Ob-201ENSMUST00000095342 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Vrk1-204ENSMUST00000220629 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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