Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Ckap5A2AGT5 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
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Ckap5A2AGT5 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms