Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Crlf3Q9Z2L7 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Crlf3Q9Z2L7 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Crlf3Q9Z2L7 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Crlf3Q9Z2L7 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Crlf3Q9Z2L7 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Crlf3Q9Z2L7 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Crlf3Q9Z2L7 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Crlf3Q9Z2L7 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Crlf3Q9Z2L7 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Crlf3Q9Z2L7 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Crlf3Q9Z2L7 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Crlf3Q9Z2L7 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Crlf3Q9Z2L7 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Crlf3Q9Z2L7 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Crlf3Q9Z2L7 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Crlf3Q9Z2L7 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Crlf3Q9Z2L7 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Crlf3Q9Z2L7 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Crlf3Q9Z2L7 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Crlf3Q9Z2L7 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Crlf3Q9Z2L7 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Crlf3Q9Z2L7 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Crlf3Q9Z2L7 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Crlf3Q9Z2L7 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Crlf3Q9Z2L7 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Crlf3Q9Z2L7 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Crlf3Q9Z2L7 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Crlf3Q9Z2L7 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Crlf3Q9Z2L7 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Crlf3Q9Z2L7 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Crlf3Q9Z2L7 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Crlf3Q9Z2L7 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Crlf3Q9Z2L7 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Crlf3Q9Z2L7 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Crlf3Q9Z2L7 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Crlf3Q9Z2L7 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Crlf3Q9Z2L7 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Crlf3Q9Z2L7 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Crlf3Q9Z2L7 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Crlf3Q9Z2L7 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Crlf3Q9Z2L7 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Crlf3Q9Z2L7 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Crlf3Q9Z2L7 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Crlf3Q9Z2L7 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Crlf3Q9Z2L7 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Crlf3Q9Z2L7 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Crlf3Q9Z2L7 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Crlf3Q9Z2L7 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Crlf3Q9Z2L7 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Crlf3Q9Z2L7 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Crlf3Q9Z2L7 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Crlf3Q9Z2L7 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Crlf3Q9Z2L7 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Crlf3Q9Z2L7 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Crlf3Q9Z2L7 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Crlf3Q9Z2L7 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Crlf3Q9Z2L7 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Crlf3Q9Z2L7 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Crlf3Q9Z2L7 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Crlf3Q9Z2L7 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Crlf3Q9Z2L7 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Crlf3Q9Z2L7 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Crlf3Q9Z2L7 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Crlf3Q9Z2L7 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Crlf3Q9Z2L7 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Crlf3Q9Z2L7 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Crlf3Q9Z2L7 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Crlf3Q9Z2L7 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Crlf3Q9Z2L7 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Crlf3Q9Z2L7 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Crlf3Q9Z2L7 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Crlf3Q9Z2L7 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Crlf3Q9Z2L7 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Crlf3Q9Z2L7 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Crlf3Q9Z2L7 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Crlf3Q9Z2L7 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Crlf3Q9Z2L7 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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