Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY0

Foxp4, Forkhead box protein P4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxp4Q9DBY0 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxp4Q9DBY0 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxp4Q9DBY0 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxp4Q9DBY0 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxp4Q9DBY0 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxp4Q9DBY0 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Foxp4Q9DBY0 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Foxp4Q9DBY0 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Foxp4Q9DBY0 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Foxp4Q9DBY0 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Foxp4Q9DBY0 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Foxp4Q9DBY0 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Gm14606-201ENSMUST00000117078 1155 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Gm11893-201ENSMUST00000117829 491 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Gm12507-201ENSMUST00000119155 415 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Gm15379-201ENSMUST00000121224 648 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Csn3-201ENSMUST00000001667 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Ppp1r2-ps9-202ENSMUST00000173852 882 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Gm7412-201ENSMUST00000191692 605 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Gm5708-201ENSMUST00000196289 886 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Samt3-201ENSMUST00000047945 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Olfr816-201ENSMUST00000071605 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 AC122539.3-201ENSMUST00000218355 1431 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Plac1-202ENSMUST00000114843 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Gm12655-202ENSMUST00000133884 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Gm14040-201ENSMUST00000139058 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Vmn1r74-201ENSMUST00000050416 915 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Csn2-201ENSMUST00000082370 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms