Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAT5

Trmu, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrmuQ9DAT5 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TrmuQ9DAT5 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TrmuQ9DAT5 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TrmuQ9DAT5 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
TrmuQ9DAT5 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TrmuQ9DAT5 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TrmuQ9DAT5 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TrmuQ9DAT5 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TrmuQ9DAT5 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TrmuQ9DAT5 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
TrmuQ9DAT5 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
TrmuQ9DAT5 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TrmuQ9DAT5 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TrmuQ9DAT5 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TrmuQ9DAT5 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TrmuQ9DAT5 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TrmuQ9DAT5 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TrmuQ9DAT5 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
TrmuQ9DAT5 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TrmuQ9DAT5 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TrmuQ9DAT5 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TrmuQ9DAT5 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TrmuQ9DAT5 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TrmuQ9DAT5 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TrmuQ9DAT5 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TrmuQ9DAT5 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TrmuQ9DAT5 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TrmuQ9DAT5 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TrmuQ9DAT5 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TrmuQ9DAT5 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
TrmuQ9DAT5 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TrmuQ9DAT5 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TrmuQ9DAT5 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.2 ms