Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Syce1Q9D495 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Syce1Q9D495 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 255.6 ms