Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms