Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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