Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYB0

Trim13, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM13, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim13Q9CYB0 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trim13Q9CYB0 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trim13Q9CYB0 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Trim13Q9CYB0 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trim13Q9CYB0 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trim13Q9CYB0 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trim13Q9CYB0 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trim13Q9CYB0 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trim13Q9CYB0 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trim13Q9CYB0 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trim13Q9CYB0 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trim13Q9CYB0 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trim13Q9CYB0 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trim13Q9CYB0 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trim13Q9CYB0 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trim13Q9CYB0 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trim13Q9CYB0 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trim13Q9CYB0 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trim13Q9CYB0 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trim13Q9CYB0 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trim13Q9CYB0 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trim13Q9CYB0 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trim13Q9CYB0 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trim13Q9CYB0 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trim13Q9CYB0 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Trim13Q9CYB0 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Trim13Q9CYB0 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Trim13Q9CYB0 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trim13Q9CYB0 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Trim13Q9CYB0 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trim13Q9CYB0 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trim13Q9CYB0 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trim13Q9CYB0 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trim13Q9CYB0 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trim13Q9CYB0 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trim13Q9CYB0 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trim13Q9CYB0 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trim13Q9CYB0 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trim13Q9CYB0 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trim13Q9CYB0 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trim13Q9CYB0 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trim13Q9CYB0 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trim13Q9CYB0 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trim13Q9CYB0 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trim13Q9CYB0 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trim13Q9CYB0 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Trim13Q9CYB0 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trim13Q9CYB0 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trim13Q9CYB0 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trim13Q9CYB0 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trim13Q9CYB0 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trim13Q9CYB0 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trim13Q9CYB0 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trim13Q9CYB0 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trim13Q9CYB0 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trim13Q9CYB0 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trim13Q9CYB0 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trim13Q9CYB0 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trim13Q9CYB0 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Trim13Q9CYB0 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Trim13Q9CYB0 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Trim13Q9CYB0 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Trim13Q9CYB0 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trim13Q9CYB0 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Trim13Q9CYB0 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trim13Q9CYB0 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trim13Q9CYB0 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trim13Q9CYB0 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trim13Q9CYB0 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trim13Q9CYB0 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trim13Q9CYB0 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trim13Q9CYB0 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trim13Q9CYB0 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trim13Q9CYB0 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trim13Q9CYB0 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trim13Q9CYB0 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trim13Q9CYB0 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trim13Q9CYB0 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trim13Q9CYB0 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trim13Q9CYB0 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trim13Q9CYB0 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trim13Q9CYB0 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trim13Q9CYB0 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trim13Q9CYB0 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trim13Q9CYB0 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trim13Q9CYB0 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trim13Q9CYB0 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trim13Q9CYB0 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trim13Q9CYB0 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
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