Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Atg3Q9CPX6 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Atg3Q9CPX6 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Atg3Q9CPX6 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Atg3Q9CPX6 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Atg3Q9CPX6 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Atg3Q9CPX6 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Atg3Q9CPX6 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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