Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms