Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Vrk3Q8K3G5 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Vrk3Q8K3G5 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Vrk3Q8K3G5 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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