Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Selenbp2-204ENSMUST00000173849 1323 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Lrit1Q8K099 Tex33-203ENSMUST00000169575 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Lrit1Q8K099 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Lrit1Q8K099 A930036I15Rik-201ENSMUST00000196018 1045 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Lrit1Q8K099 Gm8234-201ENSMUST00000198523 1107 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Lsm8-204ENSMUST00000201141 503 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Lrit1Q8K099 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Lrit1Q8K099 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Moxd2-201ENSMUST00000031937 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lrit1Q8K099 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Lrit1Q8K099 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lrit1Q8K099 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lrit1Q8K099 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrit1Q8K099 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrit1Q8K099 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrit1Q8K099 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrit1Q8K099 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Lrit1Q8K099 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrit1Q8K099 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrit1Q8K099 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrit1Q8K099 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrit1Q8K099 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrit1Q8K099 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrit1Q8K099 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrit1Q8K099 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrit1Q8K099 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrit1Q8K099 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrit1Q8K099 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrit1Q8K099 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrit1Q8K099 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrit1Q8K099 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrit1Q8K099 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrit1Q8K099 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrit1Q8K099 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrit1Q8K099 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Lrit1Q8K099 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrit1Q8K099 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Lrit1Q8K099 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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