Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
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Hpf1Q8CFE2 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Hpf1Q8CFE2 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Hpf1Q8CFE2 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Hpf1Q8CFE2 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Hpf1Q8CFE2 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Hpf1Q8CFE2 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Hpf1Q8CFE2 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Hpf1Q8CFE2 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Hpf1Q8CFE2 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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