Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Ccdc113Q8C5T8 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Ccdc113Q8C5T8 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Ccdc113Q8C5T8 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Ccdc113Q8C5T8 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Ccdc113Q8C5T8 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Ccdc113Q8C5T8 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Ccdc113Q8C5T8 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Ccdc113Q8C5T8 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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