Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Ctdsp2Q8BX07 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
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Ctdsp2Q8BX07 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Ctdsp2Q8BX07 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Ctdsp2Q8BX07 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Ctdsp2Q8BX07 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Ctdsp2Q8BX07 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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