Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Zbed4Q80WQ9 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Zbed4Q80WQ9 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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Zbed4Q80WQ9 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Zbed4Q80WQ9 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Zbed4Q80WQ9 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Zbed4Q80WQ9 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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