Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.7 ms