Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Usp49Q6P9L4 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Usp49Q6P9L4 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Usp49Q6P9L4 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Usp49Q6P9L4 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Usp49Q6P9L4 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Usp49Q6P9L4 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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Usp49Q6P9L4 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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Usp49Q6P9L4 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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Usp49Q6P9L4 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Usp49Q6P9L4 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Usp49Q6P9L4 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Usp49Q6P9L4 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Usp49Q6P9L4 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Usp49Q6P9L4 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Usp49Q6P9L4 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Usp49Q6P9L4 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms