Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms