Protein–RNA interactions for Protein: Q62147

Sspn, Sarcospan, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SspnQ62147 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SspnQ62147 Gm10465-201ENSMUST00000223133 3334 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SspnQ62147 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SspnQ62147 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SspnQ62147 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SspnQ62147 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SspnQ62147 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SspnQ62147 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SspnQ62147 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SspnQ62147 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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SspnQ62147 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SspnQ62147 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SspnQ62147 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SspnQ62147 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SspnQ62147 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SspnQ62147 Duxbl1-201ENSMUST00000049793 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SspnQ62147 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SspnQ62147 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SspnQ62147 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SspnQ62147 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SspnQ62147 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SspnQ62147 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SspnQ62147 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SspnQ62147 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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SspnQ62147 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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SspnQ62147 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
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SspnQ62147 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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SspnQ62147 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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SspnQ62147 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SspnQ62147 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SspnQ62147 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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SspnQ62147 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SspnQ62147 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SspnQ62147 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
SspnQ62147 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
SspnQ62147 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
SspnQ62147 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SspnQ62147 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SspnQ62147 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SspnQ62147 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
SspnQ62147 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
SspnQ62147 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
SspnQ62147 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
SspnQ62147 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SspnQ62147 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SspnQ62147 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
SspnQ62147 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SspnQ62147 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
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