Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms