Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
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Ccdc185Q3V118 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Ccdc185Q3V118 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Ccdc185Q3V118 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Ccdc185Q3V118 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Ccdc185Q3V118 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Ccdc185Q3V118 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms