Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms