Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.8 ms