Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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