Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms