Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms