Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccbe1Q3MI99 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccbe1Q3MI99 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccbe1Q3MI99 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccbe1Q3MI99 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccbe1Q3MI99 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccbe1Q3MI99 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccbe1Q3MI99 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccbe1Q3MI99 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccbe1Q3MI99 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccbe1Q3MI99 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccbe1Q3MI99 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccbe1Q3MI99 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccbe1Q3MI99 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccbe1Q3MI99 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccbe1Q3MI99 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccbe1Q3MI99 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccbe1Q3MI99 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccbe1Q3MI99 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccbe1Q3MI99 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccbe1Q3MI99 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccbe1Q3MI99 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccbe1Q3MI99 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccbe1Q3MI99 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccbe1Q3MI99 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccbe1Q3MI99 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccbe1Q3MI99 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccbe1Q3MI99 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccbe1Q3MI99 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccbe1Q3MI99 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccbe1Q3MI99 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccbe1Q3MI99 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccbe1Q3MI99 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccbe1Q3MI99 Apobec4-201ENSMUST00000068875 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccbe1Q3MI99 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccbe1Q3MI99 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccbe1Q3MI99 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccbe1Q3MI99 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccbe1Q3MI99 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccbe1Q3MI99 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccbe1Q3MI99 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccbe1Q3MI99 Kif3a-202ENSMUST00000118353 2178 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccbe1Q3MI99 Gm38054-201ENSMUST00000192380 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccbe1Q3MI99 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccbe1Q3MI99 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccbe1Q3MI99 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccbe1Q3MI99 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccbe1Q3MI99 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccbe1Q3MI99 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccbe1Q3MI99 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccbe1Q3MI99 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccbe1Q3MI99 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccbe1Q3MI99 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccbe1Q3MI99 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccbe1Q3MI99 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccbe1Q3MI99 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccbe1Q3MI99 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccbe1Q3MI99 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccbe1Q3MI99 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccbe1Q3MI99 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccbe1Q3MI99 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccbe1Q3MI99 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccbe1Q3MI99 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccbe1Q3MI99 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccbe1Q3MI99 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccbe1Q3MI99 Zfp672-203ENSMUST00000065533 2619 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccbe1Q3MI99 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccbe1Q3MI99 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccbe1Q3MI99 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccbe1Q3MI99 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccbe1Q3MI99 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccbe1Q3MI99 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccbe1Q3MI99 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccbe1Q3MI99 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccbe1Q3MI99 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ccbe1Q3MI99 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Ccbe1Q3MI99 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ccbe1Q3MI99 Arxes1-201ENSMUST00000057625 1580 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ccbe1Q3MI99 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ccbe1Q3MI99 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Ccbe1Q3MI99 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ccbe1Q3MI99 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ccbe1Q3MI99 Idua-202ENSMUST00000112563 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ccbe1Q3MI99 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ccbe1Q3MI99 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ccbe1Q3MI99 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ccbe1Q3MI99 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ccbe1Q3MI99 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ccbe1Q3MI99 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ccbe1Q3MI99 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ccbe1Q3MI99 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms