Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms