Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms