Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms