Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Acta1P68134 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Acta1P68134 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Acta1P68134 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Acta1P68134 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Acta1P68134 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Acta1P68134 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Acta1P68134 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Acta1P68134 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Acta1P68134 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms