Protein–RNA interactions for Protein: P61807

Snn, Stannin, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnnP61807 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
SnnP61807 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SnnP61807 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SnnP61807 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SnnP61807 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SnnP61807 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SnnP61807 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
SnnP61807 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SnnP61807 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SnnP61807 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SnnP61807 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SnnP61807 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SnnP61807 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
SnnP61807 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SnnP61807 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
SnnP61807 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SnnP61807 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SnnP61807 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SnnP61807 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SnnP61807 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SnnP61807 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
SnnP61807 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SnnP61807 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SnnP61807 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SnnP61807 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SnnP61807 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SnnP61807 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SnnP61807 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SnnP61807 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SnnP61807 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SnnP61807 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SnnP61807 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
SnnP61807 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SnnP61807 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SnnP61807 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
SnnP61807 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SnnP61807 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SnnP61807 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SnnP61807 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SnnP61807 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SnnP61807 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SnnP61807 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SnnP61807 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SnnP61807 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SnnP61807 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SnnP61807 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SnnP61807 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SnnP61807 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SnnP61807 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SnnP61807 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SnnP61807 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SnnP61807 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SnnP61807 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SnnP61807 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SnnP61807 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SnnP61807 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SnnP61807 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SnnP61807 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SnnP61807 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SnnP61807 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SnnP61807 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SnnP61807 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SnnP61807 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SnnP61807 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SnnP61807 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SnnP61807 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SnnP61807 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
SnnP61807 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SnnP61807 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SnnP61807 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SnnP61807 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SnnP61807 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SnnP61807 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SnnP61807 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SnnP61807 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SnnP61807 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SnnP61807 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SnnP61807 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
SnnP61807 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SnnP61807 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SnnP61807 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SnnP61807 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SnnP61807 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SnnP61807 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SnnP61807 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SnnP61807 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SnnP61807 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SnnP61807 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
SnnP61807 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SnnP61807 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SnnP61807 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SnnP61807 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SnnP61807 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SnnP61807 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SnnP61807 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SnnP61807 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SnnP61807 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SnnP61807 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SnnP61807 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SnnP61807 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms